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【創薬研究におけるPython基礎講座】
化合物データベースの構築方法と
化合物データベースからの構造検索方法

「ケモインフォマティクスの基礎である化合物の表記方法」 「化合物検索、化合物データベース構築」

受講可能な形式:【Live配信】or【アーカイブ配信】のみ
  • プログラミング言語PythonとPythonのケモインフォマティクス用ライブラリーであるRDKitを用いて実践的内容を解説!
    「ケモインフォマティクスの基礎である化合物の表記方法」「化合物検索、化合物データベース構築」
【こんなことが学べます】
・ケモインフォマティクスの基礎
・SQLによるデータベース検索方法、構築方法
日時 【Live配信受講】 2022年12月19日(月)  10:30~16:30
【アーカイブ配信受講】 2022年12月28日(水)  まで受付(配信期間:12/28~1/18)
会場 【Live配信受講】 Live配信セミナー(会社・自宅にいながら受講可能)  
会場地図
受講料(税込)
各種割引特典
55,000円 ( E-Mail案内登録価格 52,250円 ) S&T会員登録とE-Mail案内登録特典について
定価:本体50,000円+税5,000円
E-Mail案内登録価格:本体47,500円+税4,750円
E-Mail案内登録なら、2名同時申込みで1名分無料 1名分無料適用条件
2名で55,000円 (2名ともE-Mail案内登録必須/1名あたり定価半額27,500円)
テレワーク応援キャンペーン(1名受講)【Live配信/WEBセミナー受講限定】
1名申込みの場合:受講料( 定価 39,600円/E-Mail案内登録価格 37,620円 )

 定価:本体36,000円+税3,600円
 E-Mail案内登録価格:本体34,200円+税3,420円
1名様でLive配信/WEBセミナーを受講する場合、上記特別価格になります。
※お申込みフォームで【テレワーク応援キャンペーン】を選択のうえお申込みください。
※他の割引は併用できません。
配布資料PDFテキスト(印刷可)
オンライン配信ZoomによるLive配信 ►受講方法・接続確認(申込み前に必ずご確認ください)

セミナー視聴・資料ダウンロードはマイページから
お申し込み後、マイページの「セミナー資料ダウンロード/映像視聴ページ」に
お申込み済みのセミナー一覧が表示されますので、該当セミナーをクリックしてください。
開催日の【営業日2日前】より視聴用リンクと配布用資料のダウンロードリンクが表示されます。
(アーカイブ配信は、配信日に表示されます。)
備考※講義中の録音・撮影は固く禁じます。
「Python基本文法」の事前学習について
Pythonの基本文法について事前に学びたい方は、Udemyの無料コース「Pythonプログラミングで知っておくべき15のこと」をご受講下さい。
 

セミナー講師

ケモインフォ(株) 代表取締役 博士(薬学) 藤 秀義 氏 ≫【講師紹介】

元 アステラス製薬(株)
:計算化学・ケモインフォマティクスの専門家として、創薬研究におけるITやAI技術の活用を推進し、臨床開発候補化合物の創出に従事

セミナー趣旨

 有機化合物を扱う創薬研究や材料開発において、ケモインフォマティクスの重要性が注目されています。ケモインフォマティクスとは、化合物情報の作成、管理、検索、分析、可視化など、コンピュータ・情報科学を用いて化学分野における様々な問題を取り扱う学問領域になります。
 本講演では、ケモインフォマティクスの基礎である化合物の表記方法、さらには化合物検索、化合物データベース構築について、プログラミング言語Pythonと、Pythonのケモインフォマティクス用ライブラリーであるRDKitを用いて、実践的内容を解説致します。

 Pythonの基本文法について事前に学びたい方は、Udemyの無料コース「Pythonプログラミングで知っておくべき15のこと」( https://bit.ly/python-15-things-to-know)をご受講下さい。

セミナー講演内容

1.化合物の表記方法
 (1) MOL形式、SDF形式
 (2) SMILES記法
 (3) SMARTS記法
 (4) InChI、InChIKey

2.Pandasデータフレームを用いた化合物検索
 (1) 完全一致構造検索
 (2) 部分構造検索
 (3) 類似構造検索

3.SQLの基礎
 (1) リレーショナルデータベースについて
 (2) SQLとは?
 (3) SQLのSELECT分の基礎
 
4.SQLの実践
 (1) ChEMBLデータベースからのデータ取得
 (2) SQLite3を用いた化合物データベース構築

□質疑応答□